按照《通知》规定，清费立税后，煤炭资源税实行从价定率计征。应纳税额的计算公式如下：应纳税额=应税煤炭销售额×适用税率。

　　从上世纪80年代起，我国开始对自然资源征收资源税，征收模式都是从量定额计征：应纳税额=应税资源产品销售额×规定的单位税额。实行从量计征不管市场上煤炭的价格如何变化，企业所缴的税费额度基本不变。当煤炭产品价格上涨时，政府获得的税收并没有增加；反之，当煤炭产品价格下行时，企业的税负也不会减轻。

　　1994年的分税制改革，对资源税政策进行了较大调整，但依旧保持了原来的从量计征方式。在资源产品价格长期管制、价格波动不大的情况下，从量计征有其合理性和相对稳定性。

　　近十多年来，资源产品价格出现明显的单边向上趋势，采用从量计价的方法，很难使资源税收随着资源产品价格和资源企业收益的增长而增加，从而丧失了“促进资源合理开发”的税收调节意义，难以发挥促进资源节约和环境保护的作用。

　　2010年以来，新一轮资源税改革启动。2010年6月1日，新疆率先进行了原油、天然气的资源税改革试点，对油气以销售额为计税依据，从价计征资源税。同年12月，这项改革推广到西部12个省区。2011年11月，油气从价计征资源税的改革推广到全国。

　　相对油气资源，煤炭资源税从价计征的改革涉及面更宽，影响更大，改革也更为复杂。因此，煤炭资源税改革并未随油气资源税改革同时推出，而是被搁置了下来。